Engineering Biology PhD

我们覆盖工程生物学（Engineering Biology, EngBio）的广泛领域，并大力鼓励跨学科研究项目。研究工作围绕以下四大重点方向展开：

1. 生物工程的稳健方法：聚焦于保障工程化生物系统的安全与可靠运行，推动其向商业化应用转化。结合控制工程理论，开展计算模拟（in silico）与活体（in vivo）控制算法研究，应用于自动化生物设计平台、癌症精准用药调控、代谢工程中的生物控制器构建、资源感知型基因网络设计等。

2. 理性生物分子与生物系统设计：依托纳米技术、蛋白质结构建模与分子动力学等前沿工具，提升从头设计生物分子及其可控组装为功能性生物系统的能力。典型方向包括纳米疫苗设计、超材料工程、人造血细胞、合成原细胞及高精度微/纳米封装技术在医疗中的应用。

3. 进化引导的生物设计：正视并利用生物固有的进化特性，发展“进化感知”设计策略——既可通过降低进化干扰增强系统鲁棒性，也可主动整合定向进化等手段赋能设计流程。代表性课题涵盖进化感知工作流开发、噬菌体定向进化抗耐药菌、可进化细胞群落用于医疗、进化指导的酶工程等。

4. 数字细胞与人工智能：融合全细胞尺度数学模型（如转录、翻译、代谢）与AI/机器学习驱动的数据科学方法，实现生物系统的数字化设计。重点包括生成式AI驱动的多肽/蛋白从头设计、AI辅助底盘细胞与微生物群落设计（如废水能源回收）、以及面向组织再生的力-化学耦合建模等。