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东京海洋大学（Tokyo University of Marine Science and Technology），是日本唯一特化海洋研究与教育的国立大学。
东京海洋大学的海洋工学部（东京商船大学）的前身起源是私立三菱商船学校，成立于1875年（明治8年），东京高等商船学校在明治、大正、昭和时期与陆军军官学校和海军兵学校并称为三大最难考的学校，网罗日本英才。
海洋科学部（东京水产大学）的前身是大日本渔业协会渔业管理学院，成立于1888年（明治21年）。 两个系都有120多年的历史。 2003年10月由拥有120年以上历史的东京商船大学及东京水产大学合并而成、2004年4月开始以东京海洋大学名义招收本科生。